Η μακροχρόνια έρευνα για τα οικοσυστήματα (Long-Term Ecosystem Research – LTER) αποτελεί βασική συνιστώσα των παγκόσμιων προσπαθειών για την καλύτερη κατανόηση των οικοσυστημάτων. Μέσω της έρευνας και της παρακολούθησης, το LTER επιδιώκει να βελτιώσει τις γνώσεις μας σχετικά με τη δομή και τις λειτουργίες των οικοσυστημάτων και τη μακροπρόθεσμη ανταπόκρισή τους στους περιβαλλοντικούς, κοινωνικούς και οικονομικούς παράγοντες.
Η αποστολή του LTER-Greece είναι να προσφέρει στην επιστημονική κοινότητα, στους υπεύθυνους χάραξης πολιτικής και στην κοινωνία γενικά, έγκυρες επιστημονικές πληροφορίες και προγνωστική κατανόηση των περιβαλλοντικών, οικολογικών και κοινωνικο-οικονομικών διαδικασιών, να παράγει και να ενημερώνει λύσεις για τα τρέχοντα και μελλοντικά περιβαλλοντικά προβλήματα σε τοπικό, εθνικό, Ευρωπαϊκό και παγκόσμιο επίπεδο.
Η φιλοδοξία του LTER-Greece είναι να παρέχει υπηρεσίες προς την πολιτεία, τους ενδιαφερόμενους Φορείς και την κοινωνία, για την αντιμετώπιση των σύγχρονων περιβαλλοντικών προκλήσεων: την άμβλυνση των επιπτώσεων της κλιματικής αλλαγής, την εξασφάλιση των φυσικών πόρων, την προστασία της βιοποικιλότητας και την αντιμετώπιση των φυσικών καταστροφών. Τα παρατηρητήρια αποτελούν πόλο προσέλκυσης νέων ερευνητικών ιδεών, κοιτίδες φιλοξενίας και ανάδειξης νέων επιστημόνων, κέντρα ανάπτυξης καινοτομίας, χώρους διαβούλευσης και εφαρμογής της επιστήμης της κοινωνίας.